10 команд-участниц были поделены на две подгруппы. Из дальнейшей борьбы после групповых турниров выбыли «Альянс» и «Б-45».
В четвертьфиналах победитель группы «А» «Генератор» со счётом 7:6 переиграл четвёртую команду группы «Б» - «Фортуну». А вот победитель группы «Б» «Арбитр» уступил 3:5 КЛФ – команде замкнувшей «квартет» группы «А». С таким же счётом «Торпедо» переиграло «СтарКом». Со счётом 4:3 в пользу «Сбербанка» завершился их поединок с «Сатурном».
Так уж вышло, что все четыре команды группы «А» пробились в полуфиналы, где «Генератор» переиграл со счётом 2:1 «Сбербанк», а «Торпедо» со счётом 4:3 – КЛФ. В поединке за третье место точнее были банковские служащие – 5:4.
В матче за главный трофей «Торпедо» со счётом 4:2 взяло реванш у «Генератора» за проигрыш на групповой стадии со счётом 1:2 и стало обладателем «Кубка пенальтистов – 2016».